circRNA研究汇总 | 20190923-0929
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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布的circRNA文献17篇，下面我们一起来看看circRNA研究最近有哪些新进展。
1、综述：心脏和心血管系统中的环状RNA
论文标题：Circles in the heart and cardiovascular system.
杂 志：Cardiovasc Res
影响因子：7.014
通讯作者：Roger Sik-Yin Foo（新加坡国立大学心血管研究所）
该综述系统回顾了近年来circRNA在心脏和心血管系统中的研究。几十年来，心血管疾病（CVD）是世界范围内发病和死亡最大的疾病之一，是全球医疗保健支出的主要负担。尽管经过多年努力的CVD研究已步入正轨，但CVD的诊断，管理和治疗仍然不足。急需新颖的治疗和干预方法。现在越来越多的报道提示许多circRNA是CVD发病机理中的重要调节分子。作者列举了已发表的与CVD疾病相关的circRNA分子列表，很多研究虽然发现了大量疾病状态下失调的circRNA分子，但具体的circRNA致病机理还需澄清，目前大部分研究还是聚焦在circRNA识别miRNA海绵方向，但基于circRNA序列全局性的miRNA作用位点生信预测结果并没有提供强有力的证据。因此，这可能并不是circRNA的主要作用方式。此外，circRNA与RBP互作，直接翻译成多肽也是重要的研究方向。高通量测序实验结果表明只有30%的circRNA在小鼠和大鼠中保守，10%的circRNA在人、小鼠和大鼠心脏中保守。因此，在动物模型中针对这些保守的circRNA研究有利于阐明人类心脏疾病的作用机理。作者还重点提及了circRNA的一个少研究未开发的方向，circRNA的二级结构，circRNA的折叠方式对其功能可能有较大影响。最近一些研究表明：使用RNase V1裂解RNA的碱基配对区域并结合高通量测序方法，确定单链RNA形成完全配对或非规范配对的区域的RNA碱基配对基序（RNA motif），例如circRNA的RNA碱基配对基序可能指导理解RNA–RNA和RNA-蛋白质相互作用。circRNA的折叠对于其在细胞内源性功能也很重要，circRNA的错误折叠会导致疾病的发生。同时作者还指出，circRNA研究最有前途的前景之一是它作为CVD的循环生物标记。迄今为止，大多数研究受限于样本量小，统计分析有限和缺乏独立的验证。是否存在循环系统中的circRNA作为游离分子，与配体结合或包裹在细胞外囊泡中如外泌体，微泡和凋亡小体。还有很多其他有趣的领域值得去探索。
图注：CVD相关的circRNA
2、上调circRNA ARHGAP10通过调节miR-150-5p / GLUT-1轴可预测NSCLC的不良预后
论文标题：Upregulated circRNA ARHGAP10 Predicts an Unfavorable Prognosis in NSCLC through Regulation of the miR-150-5p/GLUT-1 Axis.
杂 志：Mol Ther Nucleic Acids
影响因子：5.919
通讯作者： chen yang（复旦大学附属华山医院泌尿科），刘建军（上海交通大学医学院附属仁济医院核医学科），黄钢（上海健康医学院院长）
该研究主要阐释了circARHGAP10在NSCLC（非小细胞肺癌）进展中的作用，之前的研究已观察到circARHGAP10在NSCLC组织和细胞系中均显著上调。荧光原位杂交（FISH）结果也显示circARHGAP10高表达且与NSCLC患者的不良预后相关。体外和体内实验均发现circARHGAP10的下调通过降低GLUT1的表达来抑制糖代谢。沉默circARHGAP10还可以通过靶向miR-150-5p / GLUT1轴来抑制NSCLC细胞增殖和转移，并得到荧光素酶报告基因检测结果证实。在敲除circARHGAP10后，GLUT1的过表达或miR-150-5p下调可恢复NSCLC细胞的增殖和转移。综上所述，这些发现表明circARHGAP10通过充当miR-150-5p海绵来促进GLUT1表达，进而抑制NSCLC进展。因此，circARHGAP10可能是NSCLC治疗的潜在靶标。
图注：NSCLC非小细胞肺癌中circRNA差异表达谱分析
3、mRNA，miRNA，lncRNA和circRNA的串扰及其在肺纤维化中的调控模式
论文标题：Crosstalk of mRNA, miRNA, lncRNA, and circRNA and Their Regulatory Pattern in Pulmonary Fibrosis.
杂 志：Mol Ther Nucleic Acids
影响因子：5.919
通讯作者：宋晓冬副教授和吕长俊教授（滨州医学院）
非编码RNA（ncRNA），例如microRNA（miRNA），长链ncRNA（lncRNA）和环状RNA（circRNA），是具有重要生物学功能的调控因子。因此，了解它们的相互间的串扰和调控模式可以为疾病治疗提供重要线索。在这项研究中，研究者通过博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型，利用高通量测序方法，获得了差异表达的RNA转录本。在肺纤维化中有差异表达的585个mRNA，236个miRNA，272个lncRNA和74个circRNA，随后验证了4个miRNA，10个lncRNA和2个circRNA。进一步分析它们在染色体上的位置，长度变异，相互作用和宿主基因。研究者选择lnc949，circ949和circ057来探索它们间的详细的串扰和调控模式，通过使用RNA-FISH，双荧光素酶报告基因测定，实时细胞分析和拯救实验，共定位分析和RNA免疫沉淀这些方法进行研究。结果显示，三种ncRNA主要定位在细胞质中，其调控模式集中于转录后。lnc949影响肺纤维化功能取决于其宿主基因FKBP5。circ949，circ057和lnc865，lnc556形成了一个调控网络，可同时调节靶向STAT3磷酸化的miR-29b-2-5p。总的来说，不同的RNA可以相互串扰，以通过不同的调节方式调节肺纤维化。该研究为肺纤维化的治疗提示了新的方向。
图注：博莱霉素诱导的小鼠肺纤维化模型中circRNA差异表达谱
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